中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究（以下簡稱昆明動(dòng)物所）所成立于1959年4月，其前身為昆蟲研究所紫膠站,1963年改名為中國科學(xué)院西南動(dòng)物研究所，1970年劃歸云南省后改名為云南省動(dòng)物研究所，1978年重歸中國科學(xué)院，恢復(fù)原所名。

　　中國科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程實(shí)施以來，昆明動(dòng)物所以“創(chuàng)新跨越、持續(xù)發(fā)展”為指導(dǎo)思想，以科學(xué)發(fā)展觀為統(tǒng)領(lǐng)，立足中國西南和東南亞豐富的生物資源，以進(jìn)化遺傳與進(jìn)化發(fā)育、生物多樣性資源利用與保護(hù)生物學(xué)、重大疾病機(jī)理與靈長類動(dòng)物模型為三大重點(diǎn)發(fā)展領(lǐng)域，相互交叉合作，開展基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性科技創(chuàng)新活動(dòng)，力爭使1～2個(gè)學(xué)科組達(dá)到國際領(lǐng)先水平，3～4個(gè)學(xué)科組進(jìn)入國際前沿。

　　昆明動(dòng)物所現(xiàn)設(shè)有遺傳資源與進(jìn)化國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國科學(xué)院動(dòng)物模型與人類疾病機(jī)理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國科學(xué)院與云南省共建的“動(dòng)物生殖生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”和“畜禽分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”，2個(gè)中國科學(xué)院-馬普青年科學(xué)家小組，人類疾病靈長類動(dòng)物模型研究團(tuán)隊(duì)，與香港中文大學(xué)聯(lián)合共建“生物資源與疾病分子機(jī)理聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室”和非法人研究單元“中國科學(xué)院昆明靈長類研究中心”。

　　2008年，昆明動(dòng)物所作為項(xiàng)目法人建設(shè)單位，與云南省人民政府共建“西南生物多樣性實(shí)驗(yàn)室”并通過可行性研究報(bào)告評(píng)審，各項(xiàng)建設(shè)工作進(jìn)展順利。院省合作共建的“昆明動(dòng)物博物館”庫藏標(biāo)本近65萬號(hào)，是我國第二大、西南地區(qū)最大的動(dòng)物標(biāo)本庫，也是我國熱帶、亞熱帶動(dòng)物種類、數(shù)量收藏最多的標(biāo)本庫，全年接待各類參觀者10余萬人。2008年，該館進(jìn)入藍(lán)版《云南省旅游護(hù)照》。研究所圖書情報(bào)中心實(shí)現(xiàn)計(jì)算機(jī)自動(dòng)化系統(tǒng)管理，通過網(wǎng)絡(luò)與院內(nèi)外文獻(xiàn)信息系統(tǒng)合作，建成了技術(shù)先進(jìn)、功能完善的文獻(xiàn)信息服務(wù)網(wǎng)絡(luò)，實(shí)現(xiàn)了資源共享；依托館藏豐富資源和Elsevier、Springer、Nature、Science、Blackwell數(shù)字化系統(tǒng)，為讀者提供各種數(shù)據(jù)庫查詢、科技查新、引文檢索、信息導(dǎo)航、信息咨詢、定題服務(wù)等信息服務(wù)。研究所科研儀器與設(shè)備總值7900多萬元，有表面等離子共振儀、全自動(dòng)克隆挑取系統(tǒng)、全自動(dòng)芯片點(diǎn)樣儀、激光共聚焦顯微鏡、流式細(xì)胞儀、多道神經(jīng)元單位放電記錄儀、基因芯片系統(tǒng)、基因分型系統(tǒng)、雙向電泳系統(tǒng)、倒置熒光顯微鏡等先進(jìn)的儀器裝置。2008年，昆明動(dòng)物所牽頭組建了“昆明生物多樣性大型儀器區(qū)域中心”，“昆明國家生物產(chǎn)業(yè)基地實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心”獲得國家發(fā)改委批準(zhǔn)建設(shè)。

　　截止2008年底，昆明動(dòng)物所共有在職職工240人，流動(dòng)人員285人離退休人員149人，進(jìn)創(chuàng)新崗位155人。在職職工中，共有科研人員213人，科技支撐人員27人，包括中科院院士1人，研究員26人，副研究員及高級(jí)工程師32人，中國科學(xué)院“百人計(jì)劃”入選者10人、“國家杰出青年科學(xué)基金”獲得者5人，項(xiàng)目聘用人員77人；流動(dòng)人員中，共有客座研究員8人、在學(xué)研究生234人（其中博士生105人，有1人是TWAS資助的外籍博士；碩士生128人）、與其他單位聯(lián)合培養(yǎng)研究生32人、在站博士后14人。研究所設(shè)有動(dòng)物學(xué)、遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)二級(jí)博士培養(yǎng)點(diǎn)和二級(jí)動(dòng)物學(xué)、遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)碩士培養(yǎng)點(diǎn)，并設(shè)有生物學(xué)一級(jí)博士后流動(dòng)站。

　　2008年，研究所共有在研項(xiàng)目225項(xiàng)（包括新增項(xiàng)目65項(xiàng)）。其中主持國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃（973）項(xiàng)目3項(xiàng)，參與課題18項(xiàng)，中國高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃（863）課題5項(xiàng)，國家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目4項(xiàng)，科技部重大專項(xiàng)4項(xiàng)；主持國家基金創(chuàng)新群體1項(xiàng)，國家基金杰出青年項(xiàng)目2項(xiàng)，國家基金重點(diǎn)項(xiàng)目11項(xiàng)，云南省—NSFC聯(lián)合基金2項(xiàng)，國家基金國際合作交流項(xiàng)目3項(xiàng)；中國科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程重要方向項(xiàng)目14項(xiàng)，中國科學(xué)院學(xué)部咨詢項(xiàng)目1項(xiàng)，中國科學(xué)院“百人計(jì)劃”項(xiàng)目2項(xiàng)，“西部之光”項(xiàng)目2項(xiàng)，“西部之光”后續(xù)支持項(xiàng)目1項(xiàng)，“西部博士”項(xiàng)目3項(xiàng)，在職博士研究生資助項(xiàng)目2項(xiàng)，社會(huì)實(shí)踐類研究生創(chuàng)新項(xiàng)目1項(xiàng)，院地合作項(xiàng)目2項(xiàng)，“生物分類學(xué)”專項(xiàng)1項(xiàng)，國家杰出青年匹配資助1項(xiàng)；國際合作項(xiàng)目4項(xiàng)；與地方政府合作項(xiàng)目12項(xiàng)。全年?duì)幦№?xiàng)目合同經(jīng)費(fèi)共計(jì)12077萬元，其中院外項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)9763萬元。

　　2008年，研究所創(chuàng)新成果顯著。在進(jìn)化遺傳與進(jìn)化發(fā)育領(lǐng)域，發(fā)現(xiàn)了一酵母新基因BSC4，對(duì)認(rèn)識(shí)新基因起源進(jìn)化有重要意義，相關(guān)結(jié)果發(fā)表在《Genetics》上；提出種內(nèi)microRNA導(dǎo)致的基因組范圍的表達(dá)譜變異在進(jìn)化中可能有助于物種對(duì)環(huán)境的適應(yīng)，為基因表達(dá)水平提供了更寬廣的“緩沖帶”，研究結(jié)果發(fā)表于國際知名生命科學(xué)刊物《Nucleic Acids Research》。在重大疾病機(jī)理與靈長類動(dòng)物模型領(lǐng)域，發(fā)現(xiàn)了辣椒素能保護(hù)大腦海馬結(jié)構(gòu)的記憶功能，該發(fā)現(xiàn)發(fā)表在生物精神病學(xué)《Biological Psychiatry》雜志上；與中山大學(xué)合作發(fā)現(xiàn)特定線粒體DNA（mtDNA）單倍型類群對(duì) Leber遺傳性視神經(jīng)病變發(fā)病與否有重要影響，研究結(jié)果發(fā)表在生命科學(xué)領(lǐng)域國際頂尖雜志《The American Journal of Human Genetics》上。研究所主持承擔(dān)的2項(xiàng)國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目（973）和1項(xiàng)重大科學(xué)研究計(jì)劃（973）順利通過國家科技部組織的項(xiàng)目中期總結(jié)和評(píng)估。

　　2008年全所共發(fā)表各類科技論文202篇，其中，SCI刊物發(fā)表論文150篇（占論文總數(shù)的74.25%），累計(jì)影響因子420.369，SCI論文平均影響因子2.869，在本領(lǐng)域TOP30%的SCI刊物發(fā)表論文60篇，CSCD刊物52篇；申請(qǐng)專利11項(xiàng)，受理11項(xiàng)，授權(quán)2項(xiàng)；完成科技成果登記工作4項(xiàng)；獲得云南省科技成果獎(jiǎng)3項(xiàng)，其中自然科學(xué)獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)1項(xiàng)，二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，科技進(jìn)步獎(jiǎng)1項(xiàng)。

　　2008年，昆明動(dòng)物所共派出科研人員47人次，接待外賓180人次；與國外專家合作發(fā)表論文23篇；有在研國際合作項(xiàng)目12項(xiàng)；承辦“2008中科院－晨興靈長類生物醫(yī)學(xué)國際研討會(huì)”和“藥物成癮機(jī)制與臨床防治途徑國際研討會(huì)”2個(gè)國際會(huì)議；建立了“國際生命條形碼（iBOL）中國委員會(huì)”辦公室。

　　昆明動(dòng)物所是云南省動(dòng)物學(xué)會(huì)、云南省昆蟲學(xué)會(huì)、云南省細(xì)胞與生物學(xué)會(huì)、云南省免疫學(xué)會(huì)的掛靠單位，負(fù)責(zé)編輯出版動(dòng)物學(xué)核心刊物《動(dòng)物學(xué)研究》，該刊物被評(píng)為2008年度中國精品科技期刊。