歷史沿革： 籌建于1958年10月，1959年8月正式成立，時稱中國科學院上海理化研究所，2003年6月經(jīng)國家批準定為現(xiàn)名。擁有兩大園區(qū)，分別坐落于上海市科技衛(wèi)星城嘉定區(qū)和張江高科技園區(qū)，占地面積共約700畝。是專業(yè)從事民用非動力核技術科學研究的國立研究所，以同步輻射等先進光源技術、束線技術及離子束技術研究，標記化合物與放射性藥物、輻照新材料及輻照裝置、先進探測與成像技術等民用非動力核技術科學的基礎、應用研究及其相關交叉、邊緣學科研究為主，同時積極推進民用非動力核技術科學研究成果的產(chǎn)業(yè)化。

學科領域與方向： 學科領域為：先進光源和束線、先進離子束的科學與技術研究，核物理及交叉、邊緣學科研究，核技術科學的應用研究等。主要學科方向包括：先進光源和束線的科學與技術研究，基于N&NBIU（核科學與納米科技、生命科學、信息技術、超快技術）匯聚技術的交叉科學研究，核物理實驗和理論研究，核技術科學的應用研究等。

機構(gòu)設置： 分為基礎研究部門、應用研究中心、技術支撐部門、管理部門、科技企業(yè)五大類，基礎研究部門中包括專門從事上海光源工程工作的技術部。建有“中國科學院核分析技術重點實驗室”、“上海市低溫超導高頻腔技術重點實驗室”。

人員狀況： 截止2005年底，全所共有在職職工725人，其中科技人員482人，中國科學院院士1人，研究員級科技人員52人。設有粒子物理與原子核物理、核技術及應用、無機化學博士、碩士學位培養(yǎng)點，設有光學工程、電磁場與微波技術、信號與信息處理碩士學位培養(yǎng)點，設有物理學、核技術及應用博士后流動站。共計在學研究生277人，其中博士生139人；另有在站博士后5人。

在研（建）重大項目： 上海光源（SSRF）國家重大科學工程，國家973項目 “基于超導加速器SASE自由電子激光的關鍵物理及技術問題研究”，國家發(fā)展改革委民用非動力核技術高技術產(chǎn)業(yè)化專項“輻射改性功能型高分子新材料高技術產(chǎn)業(yè)化示范工程”和“輻射加工用新型電子加速器系列產(chǎn)業(yè)化示范工程”，中科院創(chuàng)新重大項目“核技術應用的關鍵技術”等。

突出成果： 建所以來共取得科研成果600余項，獲各類科技獎項163項，其中國家科技進步獎5項、國家自然科學獎4項。“重離子核反應的集體效應、奇異核產(chǎn)生及其性質(zhì)研究”、“重質(zhì)量豐中子新核素的合成鑒別和研究”獲國家自然科學二等獎。

交流與合作： 重點圍繞光源技術和自由電子激光技術，與國際上擁有同步輻射裝置的研究單元開展全面合作；同時開展其他相關交叉學科及高新技術領域的多元化國際合作。在光源技術領域，已與英國DIAMOND、日本Spring-8、意大利ELETTRA與瑞士保羅·謝爾研究所（PSI）、新加坡SSLS、日本同步輻射研究會及日本佐賀大學同步輻射光應用中心簽訂所級合作協(xié)議，與日本KEK國家實驗室共同執(zhí)行據(jù)點大學合作協(xié)議，與韓國PLS、法國ESRF、德國BESSY-II等機構(gòu)確立合作與交流關系，與美國五大實驗室保持頻繁的人員交流與技術合作；在交叉學科研究領域，與德國德勒斯登Rossendorf研究中心、德國萊比錫大學LIPSION實驗室開展了良好的國際合作研究工作；在核物理研究領域，2001年加入RICH-STAR國際合作計劃（項目）；與中科院高能物理所建立了所級合作關系。

學術刊物： 主辦《核技術》、《核科學技術》（英文版）、《輻射研究和輻射工藝學報》等學術刊物。上海市原子核學會、中國物理學會同步輻射專業(yè)委員會、中國核學會輻射研究與輻射工藝學分會掛靠上海應用物理所。

    2005年是研究所實施知識創(chuàng)新工程承前啟后的轉(zhuǎn)折之年，也是承擔上海光源國家重大科學工程建設的開局之年。全年完成研究所實施知識創(chuàng)新工程試點二期的總結(jié)評估，制訂研究所十五年中長期發(fā)展規(guī)劃和知識創(chuàng)新工程三期工作方案，確定成為以“應用”為特色、國際先進、有中國特點的依托基于核技術（加速器）科學的大科學裝置的多學科綜合性科學研究基地的發(fā)展目標。

    2005年，上海光源工程加速器各系統(tǒng)設計經(jīng)過專家評審后，進入樣機研制階段，并已開展34項設備招標；完成首批7條光束線站設計方案、技術指標等的優(yōu)化調(diào)整；公用設施工程完成工程設計和大部設備招標；建筑安裝工程攻克抗微振動、控制不均勻沉降和異型屋面等設計難關，主體建筑基礎工程已經(jīng)基本完工，進入上部結(jié)構(gòu)施工階段，輔助建筑結(jié)構(gòu)封頂——上海光源工程建設進展得到上海市和中科院領導的充分肯定。100MeV電子直線加速器順利通過專家鑒定測試；973項目“放射性核束物理和核天體物理”通過科技部結(jié)題評審并獲得好評；基于N&NBIU的交叉學科研究發(fā)表多篇高水平論文。精心組織實施民用非動力核技術高技術產(chǎn)業(yè)化專項項目，與北京紫泉能源環(huán)境技術有限公司合作承建的山東利津熱電廠煙氣脫硫示范工程正式啟動，探索科技成果轉(zhuǎn)化新機制、新模式。創(chuàng)新一期、二期園區(qū)基本建設項目全部完成，并順利通過中科院組織的竣工專業(yè)驗收。積極擴大國際國內(nèi)學術交流與合作，與新加坡光源簽訂所級合作協(xié)議，與英國DIAMOND光源、美國伯克利國家實驗室和俄羅斯BINP草擬合作協(xié)議。

    在明確了未來發(fā)展方向之后，上海應用物理研究所將在中國科學院新時期辦院方針指導下，面向科學前沿、面向國家需求，以完成上海光源國家重大科學工程建設任務為工作重點，為研究所的持續(xù)發(fā)展打好基礎。