南京水利科學(xué)研究院建于1935年，原名中央水工試驗(yàn)所，是我國最早成立的水利研究機(jī)構(gòu)。直屬國家水利部、交通部、電力工業(yè)部。

　　本院是面向國內(nèi)外的綜合性水利科學(xué)研究機(jī)構(gòu)，兼有應(yīng)用、基礎(chǔ)和開發(fā)研究，承擔(dān)水利、水電、水運(yùn)工程和其它有關(guān)工程中方向性、關(guān)鍵性和綜合性的科學(xué)試驗(yàn)研究任務(wù)，以及理論和管理方面的研究，并兼作水利部水利大壩安全監(jiān)測(cè)中心和基本建設(shè)工程質(zhì)量檢測(cè)中心。承擔(dān)全國水利大壩安全監(jiān)測(cè)和各類工程質(zhì)檢、監(jiān)理工作。設(shè)有水文水資源研究所、水工水力學(xué)研究所、河流海岸研究所、巖土工程研究所、材料結(jié)構(gòu)研究所、大壩安全與管理研究所、水利信息技術(shù)研究中心等研究所和中心、勘測(cè)設(shè)計(jì)院、工程質(zhì)量檢測(cè)中心。設(shè)有農(nóng)村電氣化研究所、瑞迪高新技術(shù)公司、江蘇南水土建工程公司、科興工程監(jiān)理有限公司、運(yùn)達(dá)科工貿(mào)公司等研究開發(fā)機(jī)構(gòu)。已形成30多個(gè)具有一定特色和優(yōu)勢(shì)的專業(yè)研究方向。

　　主要研究?jī)?nèi)容有：水文基礎(chǔ)理論、水旱災(zāi)害規(guī)律及減災(zāi)戰(zhàn)略、水資源宏觀戰(zhàn)略、水環(huán)境演變及對(duì)策、水文、水資源與水環(huán)境關(guān)鍵技術(shù)、水資源可持續(xù)利用、水工水力學(xué)，水工建筑物滲流和地下水開發(fā)利用，航運(yùn)樞紐，通航建筑物及漁業(yè)工程水利學(xué)，河流動(dòng)力學(xué)及樞紐泥沙，河道整治，潮汐河口治理，海岸演變及海港防淤措施，防浪掩護(hù)與波浪對(duì)建筑物的作用，地基加固及基礎(chǔ)工程，土體變形及土與建筑物共同作用，土石壩筑壩技術(shù)，土工測(cè)試技術(shù)，水工、港工大塊體結(jié)構(gòu)在長(zhǎng)期荷載作用下受力狀態(tài)，深水筑港技術(shù)和結(jié)構(gòu)振動(dòng)與抗震問題，港工、水工鋼筋混凝土與預(yù)應(yīng)力混凝土結(jié)構(gòu)受力問題，混凝土與鋼筋混凝土耐久性及鋼材腐蝕與防護(hù)技術(shù)，水工、港工混凝土，鋼筋混凝土施工技術(shù)，環(huán)境工程，土工聚合物，核技術(shù)在水利、水電、水運(yùn)工程中的應(yīng)用，儀器設(shè)備與測(cè)試技術(shù)開發(fā)，科技情報(bào)分析，工程技術(shù)與效益評(píng)價(jià)等。平均每年承擔(dān)科研任務(wù)500多項(xiàng)，提出科研成果200多項(xiàng)。1978年以來，已有311項(xiàng)科研成果獲國家、部、省級(jí)重大科技成果獎(jiǎng)，內(nèi)容涉及樞紐泥沙、船閘水力學(xué)、紊流結(jié)構(gòu)、地下水資源、海堤調(diào)查、海岸沖刷、工程材料與結(jié)構(gòu)、筑壩技術(shù)、軟基加固、航道整治、港口建設(shè)、壩體滲流、污水排放、河工模型、淤泥質(zhì)海岸治理、土工織物、遙感技術(shù)等。

　　全院現(xiàn)有職工約900人，其中中國科學(xué)院院士3名，其中高級(jí)科研人員350名。 全院占地面積400，000余平方米，擁有2000M2以上的大型試驗(yàn)廳、室20余座，各類儀器設(shè)備4000臺(tái)件。全院藏有中、外文圖書、資料和期刊23萬卷冊(cè)，定期公開出版的刊物有《水利水運(yùn)科學(xué)研究》、《海洋工程》（中文版）、《海洋工程》（英文版，國外發(fā)行）、《巖土工程學(xué)報(bào)》、《水科學(xué)進(jìn)展》。中國水利學(xué)會(huì)巖土工程專業(yè)委員會(huì)、中國海洋工程學(xué)會(huì)的辦事機(jī)構(gòu)設(shè)在本院。

　　本院十分重視國際交流和合作。已有眾多國家和地區(qū)的學(xué)者來院參觀、講學(xué)和進(jìn)行技術(shù)交流。曾多次承擔(dān)國外工程科研項(xiàng)目，接受國外聘請(qǐng)派員出國講學(xué)、工作或進(jìn)行合作研究。有些高級(jí)科研人員在國際學(xué)術(shù)組織中擔(dān)任職務(wù)。目前本院與許多國家和地區(qū)的科研單位和高等院校建立了科技資料交流關(guān)系或雙邊合作關(guān)系。

　　經(jīng)國務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)，本院為國家首批有關(guān)學(xué)科的博士、碩士學(xué)位授予單位，并是有關(guān)學(xué)科的博士后流動(dòng)站。