中國科學院沈陽應(yīng)用生態(tài)研究所(前身中國科學院林業(yè)土壤研究所)成立于1954年，是以林業(yè)、土壤、植物、微生物與環(huán)境科學為基礎(chǔ)的綜合性應(yīng)用生態(tài)學研究機構(gòu)。現(xiàn)有高級科技人員110人，其中正高級專業(yè)技術(shù)人員57人，中國工程院院士1人，國家“千人計劃”1人，973首席科學家3人，國家杰出青年基金獲得者3人，中科院“百人計劃”10人。

　　該所瞄準國家重大需求和國際學科前沿，以應(yīng)用生態(tài)學為主攻學科，以實驗生態(tài)學方法和現(xiàn)代生物技術(shù)、信息技術(shù)為主要手段，以陸地主要生態(tài)系統(tǒng)為研究對象，重點開展生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)過程與格局、退化生態(tài)系統(tǒng)恢復(fù)與重建、生態(tài)系統(tǒng)調(diào)控與管理等方面的研究，豐富和發(fā)展應(yīng)用生態(tài)學理論與技術(shù)體系，為保障區(qū)域生態(tài)安全和可持續(xù)發(fā)展，實現(xiàn)人與自然的和諧提供科學基礎(chǔ)、決策依據(jù)和關(guān)鍵技術(shù)，在國家應(yīng)用生態(tài)學科技創(chuàng)新體系中發(fā)揮引領(lǐng)作用。

　　近期主要圍繞森林生態(tài)與林業(yè)生態(tài)工程、土壤生態(tài)與農(nóng)業(yè)生態(tài)工程、污染生態(tài)與環(huán)境生態(tài)工程三大重點學科領(lǐng)域，從事森林生態(tài)系統(tǒng)格局與過程、森林植被恢復(fù)與環(huán)境效應(yīng)、農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)物質(zhì)循環(huán)與調(diào)控、微生物資源與生物技術(shù)、污染生態(tài)過程與生態(tài)毒理、土壤環(huán)境與生態(tài)修復(fù)及區(qū)域生態(tài)安全與可持續(xù)發(fā)展等研究方向開展應(yīng)用基礎(chǔ)性研究工作。

　　研究所下設(shè)森林與土壤生態(tài)國家重點實驗室、中國科學院污染生態(tài)與環(huán)境工程重點實驗室、遼寧省陸地生態(tài)過程與生態(tài)安全重點實驗室、遼寧省節(jié)水農(nóng)業(yè)重點實驗室、遼寧省生態(tài)公益林管理重點實驗室、遼寧省植物資源保護利用重點實驗室、遼寧省土壤環(huán)境與農(nóng)產(chǎn)品安全重點實驗室;擁有中國科學院長白山森林生態(tài)系統(tǒng)定位研究站(國家野外觀測站、CERN重點站)，中國科學院沈陽生態(tài)實驗站(國家野外觀測站、CERN重點站)，中國科學院會同森林生態(tài)實驗站(國家野外觀測站、CERN重點站)，烏蘭敖都荒漠化實驗站(國家林業(yè)局荒漠化監(jiān)測中心之一)，清原森林生態(tài)實驗站，大青溝生態(tài)研究站，額爾古納森林草原過渡帶生態(tài)系統(tǒng)研究站，沈陽生態(tài)植物園和東北生物標本館與東亞苔蘚研究中心。研究所編輯出版《應(yīng)用生態(tài)學報》和《生態(tài)學雜志》兩個國家核心期刊及《Ecological Processes》國際期刊。

　　本所為1981年國務(wù)院學位委員會首批批準的博士學位點�，F(xiàn)有生態(tài)學、土壤學、微生物學、環(huán)境科學四個博士學位點和生態(tài)學、微生物學、植物學、環(huán)境科學、土壤學、森林培育學六個碩士學位點�，F(xiàn)有在讀研究生326人，其中博士生147人、碩士生179人。設(shè)有生物學和農(nóng)業(yè)資源利用2個一級學科博士后流動站，包括生態(tài)學、微生物學、土壤學3個專業(yè)站點�，F(xiàn)有在站博士后25人。研究所建有集教學、生活、娛樂為一體的研究生綜合樓。研究生招生全部為公費生。